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搜索算法可助科學(xué)家發(fā)現(xiàn)腫瘤標(biāo)志物

搜索算法可助科學(xué)家發(fā)現(xiàn)腫瘤標(biāo)志物

2012-05-29 16:58:10

  搜索引擎不但能夠用來(lái)查找網(wǎng)頁(yè),還能被用來(lái)確定腫瘤標(biāo)志物。據(jù)物理學(xué)家組織網(wǎng)近日?qǐng)?bào)道,德國(guó)德累斯頓工業(yè)大學(xué)的研究人員日前使用改良過(guò)的搜索引擎算法發(fā)現(xiàn)了7個(gè)腫瘤標(biāo)志物,這些標(biāo)志物不但可以幫助醫(yī)生對(duì)患者的病情作出準(zhǔn)確診斷,還能幫助研究人員據(jù)此開(kāi)發(fā)出新的抗癌藥物,在臨床上具有重要價(jià)值。相關(guān)論文發(fā)表在最新一期的《美國(guó)公共科學(xué)圖書(shū)館·計(jì)算生物學(xué)》上。

  此前要找到這些標(biāo)志物需要經(jīng)過(guò)大量的實(shí)驗(yàn),不但費(fèi)時(shí)而且費(fèi)力。另外一個(gè)問(wèn)題是,在不同的研究中所發(fā)現(xiàn)的標(biāo)志物總是各不相同,無(wú)法相互印證。德累斯頓工業(yè)大學(xué)的科學(xué)家發(fā)現(xiàn)這與搜索引擎在處理大量重復(fù)網(wǎng)頁(yè)和超鏈接時(shí)所遇到問(wèn)題頗有幾分類(lèi)似。于是他們對(duì)谷歌網(wǎng)頁(yè)排名(PageRank)算法進(jìn)行了改造,按與胰腺癌的相關(guān)性對(duì)2萬(wàn)個(gè)蛋白質(zhì)進(jìn)行了排序,結(jié)果從中發(fā)現(xiàn)了7個(gè)腫瘤標(biāo)志物。這些生物標(biāo)志物可以幫助醫(yī)生對(duì)癌癥早期的體液或由手術(shù)中所獲得的活體組織進(jìn)行檢查,以確定患者是否需要接受化療。

  研究人員發(fā)現(xiàn),一旦將網(wǎng)絡(luò)信息加入到分析當(dāng)中,這些標(biāo)志物就會(huì)變得更易重復(fù)。其中一項(xiàng)就與美國(guó)北卡羅來(lái)納大學(xué)早期的一項(xiàng)重要發(fā)現(xiàn)相重疊,該標(biāo)志物能對(duì)胰腺癌的侵略性進(jìn)行評(píng)估。

  論文第一作者克里斯托夫·文特說(shuō),雖然新的生物標(biāo)志物看起來(lái)比目前所使用的更多更全面,但它們還需要經(jīng)過(guò)進(jìn)一步的研究和臨床試驗(yàn)才能獲得應(yīng)用。“但不管怎么說(shuō),我們成功邁出了第一步。”文特說(shuō)。目前該研究小組已經(jīng)與幾家生物技術(shù)公司展開(kāi)了合作,胰腺癌藥物的臨床試驗(yàn)也已逐步展開(kāi)。(新華網(wǎng))

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