此后，毛小平行政職務一再被降低，又從正廳級領導干部被降到正處級非領導職務。隨著案情查處的進展，2012年2月29日，江蘇省委常委會經研究決定，對毛小平予以開除黨籍處分。4月5日，中央批示同意江蘇省委開除毛小平黨籍的決定。
中紀委派專人到江蘇督辦
據記者了解，毛小平一案是由中紀委直接派專人到江蘇省進行督辦的。
熟悉紀檢監察部門工作的一位人士告訴記者，從毛小平的突然案發和快速查處的情況看，近些年來，紀委查處案件已越來越謹慎，“不像以前一樣遇到一些舉報時直接(或和被舉報者所在單位黨委的陪同下)找被舉報者談話，而是不驚動對方，事先由紀委進行調查摸底。”
這種變化，除了在于避免被舉報者或被調查者所在單位的黨委進行干預外，另一方面也是出于紀委提高辦案效率的考慮。紀委直接調查，往往容易查出“窩案”。
鑒于中紀委對毛小平一案進行重點督辦，江蘇省委書記和省紀委亦高度重視，積極配合。正如江蘇省委羅志軍所強調的對“違紀犯法者，堅決查處，絕不姑息”，中紀委于2011年12月7日決定對毛小平案進行督辦，15天后，毛即被免職。（南方日報）