相對于射頻消融治療來說，微波消融還具有更多理論上的優勢。如微波可以用于各種組織腫瘤的治療，在對組織的加熱過程中，它不會受到電阻和傳導性的影響和制約。微波可以使組織溫度升得更快、更高，這也意味著手術時間更短、更安全。相對于射頻，電磁波能量可以解決血流的冷卻效應問題，對靠近血管的腫瘤也有很好的熱效應。但是與射頻消融相比較，微波治療的范圍不易精確調節。
冷凍治療準確性高
冷凍技術同樣是通過工作探針刺入腫瘤內部，但其是通過低溫冷凍系統使組織細胞降溫，導致腫瘤細胞脫水、破裂。同時冷凍還可以使微血管收縮、血流緩慢、微血栓形成，從而導致血流受阻、腫瘤組織缺血壞死。被破壞的細胞作為抗原，還可以刺激機體產生抗體，提高免疫能力。對于使細胞壞死、蛋白變性來說，至少要低于-40℃的低溫才可以起到治療作用。
相對于微波和射頻消融治療，在冷凍時可以應用影像檢查實時監控冷凍作用范圍，使冷凍作用的范圍超過腫瘤邊緣1 厘米，從而收到確切的治療效果。而微波和射頻消融治療腫瘤與正常組織之間沒有明顯的對比。
根據目前的研究，相同情況的腎臟腫瘤患者，三者的治療效果均與保留腎單位的手術治療相似。總體來說，能量消融治療腎臟腫瘤除適用于因心、肺、肝等功能較差不能耐受外科手術的患者，以及晚期腫瘤、腎癌術后復發及轉移的姑息治療，還特別適用于雙側腎癌、孤立腎腎癌、腎功能不全的腎癌、移植腎腎癌、遺傳性腎癌，以及曾行腎部分或根治性腎切除的腎癌患者，對于最大直徑小于8 厘米（尤其是小腎癌，直徑小于4 厘米）、無遠處轉移及腎靜脈瘤栓形成的腎癌患者，也可以采用該類方法治療。